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国家质检总局负责管理质量监督检验检疫方面的国际合作与交流。国家质检总局与世界大多数国家和地区的相关主管部门建立了合作关系，与许多国家和地区建立了双边磋商合作机制；积极参与双边、多边及区域经济体的合作，单独或参与外交部、商务部与有关国家进行磋商和谈判；以备忘录、议定书、会谈纪要、合作协议等多种形式，与50个国家和地区签署了多项双边合作文件。
国家质检总局参与许多国际组织和区域组织的活动，主要包括：世界贸易组织（WTO）、国际标准化组织（ISO）、国际电工委员会（IEC）、联合国食品法典委员会（CAC）、国际植物保护公约（IPPC）、国际米制公约组织、国际法制计量组织（OIML）、亚太经合组织（APEC）、亚欧会议（ASEM）、上海合作组织（TheShanghai Cooperation Organization）、亚太法制计量论坛（APLMF）等。
经国务院批准，国家质检总局为全国技术性贸易措施部级联席会议的牵头单位，负责全国技术性贸易措施的协调工作。国家质检总局负责WTO《TBT协定》和《SPS协定》的实施和国家通报咨询的国内协调工作。中国WTO/TBT、SPS国家咨询点设在国家质检总局。
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